সরকারি উদ্যোগের পাশপাশি দেশের বিভিন্ন এলাকায় প্রতিবন্ধী শিশুদের শিক্ষার অধিকার নিশ্চিত করার লক্ষ্যে বেসরকারিভাবে বিভিন্ন এনজিও বা প্রতিষ্ঠানের উদ্যেগে প্রতিবন্ধী শিশুদের জন্য বিশেষায়িত বিদ্যালয় পরিচালিত হচ্ছে। এ সকল বেসরকারি উদ্যোগকে সরকরিভাবে পৃষ্ঠপোষকতা ও সহায়তা করার লক্ষ্যে সরকার ‘প্রতিবন্ধিতা সম্পর্কিত সমন্বিত বিশেষ শিক্ষা নীতিমালা-২০০৯’ প্রণয়ন করেছে। বর্তমানে এ নীতিমালায় সমাজকল্যাণ মন্ত্রণালয় আওতায় সারা দেশে ৭৪টি বুদ্ধি প্রতিবন্ধী বিদ্যালয়ের শিক্ষকদের শতভাগ বেতন সহায়তা প্রদান করছে। এ কার্যক্রমটি  সমাজকল্যাণ মন্ত্রণালয় নিয়ন্ত্রণাধীন জাতীয় প্রতিবন্ধী উন্নয়ন ফাউন্ডেশন বাস্তবায়ন করে থাকে। বর্তমানে উক্ত স্কুলসমূহে ৯১৪ জন শিক্ষক/কর্মচারী এবং ১১৬৫০ জন ছাত্র/ছাত্রী রয়েছে। সরকার এ খাতে ২০২১-২০২২ অর্থ বছরে বাজেট এ  ৩৪.৮২ কোটি টাকা বরাদ্দ রয়েছে।

 উল্লেখ্য, নতুনভাবে বিভিন্ন জেলা ও উপজেলা থেকে প্রাপ্ত ২৭ টি প্রতিবন্ধী বিদ্যালয় এমপিওভুক্তির জন্য প্রশাসনিক মন্ত্রণালয়ে প্রেরণ করা হয়েছে।